Ο Ειδικός Λογαριασμός λειτουργεί στα Α.Ε.Ι. με σκοπό την διοίκηση και διαχείριση των έργων που εκτελούνται σ’ αυτά. Σύμφωνα με το Ν.4485/2017 άρθρο 52 έως 58 (ΦΕΚ 114/4-8-2017), Διοίκηση και Διαχείριση του Ε.Λ.Κ.Ε. αποτελούν:
Τα Όργανα διοίκησης και διαχείρισης του Ε.Λ.Κ.Ε. είναι:
α. Η Επιτροπή Ερευνών του Ε.Λ.Κ.Ε. (εφεξής, η Επιτροπή).
β. Ο Πρόεδρος της Επιτροπής Ερευνών του Ε.Λ.Κ.Ε..
Η Επιτροπή Ερευνών του Ε.Λ.Κ.Ε. (εφεξής, η Επιτροπή) έχει συγκροτηθεί ως παρακάτω:
Πρόεδρος : Χρίστος Χαλκιάς, Αντιπρύτανης Έρευνας, Ανάπτυξης και Δια Βίου Μάθησης, Καθηγητής του Τμήματος Γεωγραφίας, με αναπληρώτρια την Καθηγήτρια του Τμήματος Πληροφορικής και Τηλεματικής, Μαρία Νικολαΐδη, Πρύτανη
Αντιπρόεδρος : Αλεξάνδρα Τραγάκη, Καθηγήτρια του Τμήματος Γεωγραφίας, με αναπληρωματικό της μέλος, μόνο ως προς την ιδιότητά της ως εκπροσώπου του Τμήματος Γεωγραφίας, τον κ. Πέτρο Κατσαφάδο, Αναπληρωτή Καθηγητή του Τμήματος Γεωγραφίας
Μέλος : Γεώργιος – Πάρις Τσάρτας, Καθηγητής του Τμήματος Οικονομίας και Βιώσιμης Ανάπτυξης, με αναπληρωτή αυτού την Αναπληρώτρια Καθηγήτρια κα Ελένη Σαρδιανού
Μέλος : Αντωνία – Λήδα Ματάλα, Καθηγήτρια του Τμήματος Επιστήμης Διαιτολογίας-Διατροφής, με αναπληρώτρια αυτής την κα Αδαμαντίνη Κυριακού, Αναπληρώτρια Καθηγήτρια του Τμήματος Επιστήμης Διαιτολογίας-Διατροφής
Μέλος : Ηρακλής Βαρλάμης, Αναπληρωτής Καθηγητής του Τμήματος Πληροφορικής και Τηλεματικής, με αναπληρωτή αυτού τον κ. Γεώργιο Δημητρακόπουλο, Αναπληρωτή Καθηγητή του Τμήματος Πληροφορικής και Τηλεματικής
Ο Πρόεδρος της Επιτροπής Ερευνών του Ε.Λ.Κ.Ε..
Πρόεδρος : Χρίστος Χαλκιάς, Αντιπρύτανης Έρευνας, Ανάπτυξης και Δια Βίου Μάθησης, Καθηγητής του Τμήματος Γεωγραφίας.
Η Μονάδα Οικονομικής και Διοικητικής Υποστήριξης του Ε.Λ.Κ.Ε. (εφεξής, η Μονάδα) είναι η αρμόδια υπηρεσία για τη διοικητική υποστήριξη και οικονομική διαχείριση του Ε.Λ.Κ.Ε..
Ο Προϊστάμενος της Μονάδας Οικονομικής και Διοικητικής Υποστήριξης (ΠΜΟΔΥ) προΐσταται των υπηρεσιών της Μονάδας και ασκεί καθήκοντα Προϊσταμένου Οικονομικών Υπηρεσιών (ΠΟΥ) για τον Ε.Λ.Κ.Ε. είναι ο Σουλιώτης Δημήτριος
Ο Επιστημονικός Υπεύθυνος (ΕΥ) κάθε προγράμματος/έργου ευθύνεται για την εκτέλεση του φυσικού αντικειμένου του.
Η Σύγκλητος του οικείου Α.Ε.Ι.:
α. Εγκρίνει τον Οδηγό Χρηματοδότησης και Διαχείρισης του Ε.Λ.Κ.Ε.,
β. παρακολουθεί και ελέγχει την επιστημονική στρατηγική και τον οικονομικό προϋπολογισμό και απολογισμό του και
γ. αποφασίζει, ύστερα από εισήγηση της Επιτροπής έως το τέλος του τρίτου μήνα της επόμενης χρήσης για την κατανομή των ετήσιων εσόδων των περιπτώσεων δ΄, ε΄,
ζ΄, η΄ και θ΄ της παραγράφου 1 του άρθρου 51 μεταξύ του Ε.Λ.Κ.Ε. του Α.Ε.Ι., του τακτικού προϋπολογισμού του Α.Ε.Ι. και της Εταιρείας Αξιοποίησης και Διαχείρισης της Περιουσίας του Α.Ε.Ι., για την αντιμετώπιση των αναγκών τους.